Ötven egynéhány intézmény fog átalakulni, beolvadni más szervezetbe, vagy miniszteri felügyelet alá kerülni. 

Az alábbi intézmények pedig átalakulnak: 

• A Magyar Nemzeti Digitális Archívum és Filmintézet feladatait a Magyar Nemzeti Filmalap látja majd el.
• A Nemzeti Művelődési Intézet feladatai a Lakitelken működő Népfőiskola Alapítványhoz kerülnek.
• Az Oktatáskutató és Fejlesztő Intézet feladatait a Könyvtárellátó Nonprofit Kft. látja majd el.
• Az Egészségügyi Készletgazdálkodási Intézet, az Országos Vérellátó Szolgálat, a Nemzeti Egészségfejlesztési Intézet, az Országos Közegészségügyi Központ, valamint az Országos Epidemiológiai Központ  mind az Állami Egészségügyi Ellátó Központba olvadnak.
• A Nemzeti Kulturális Alap Igazgatósága az Emberi Erőforrás Támogatáskezelővel egyesül.
• Jogutódlással megszűnik a Mezőgazdasági és Vidékfejlesztési Hivatal és a Nemzeti Földalapkezelő Szervezet is.
• A Nemzeti Élelmiszerlánc-biztonsági Hivatal (Nébih) hatósági feladatait a fővárosi és megyei kormányhivatalok látják majd el.
• Az Országos Környezetvédelmi és Természetvédelmi Főfelügyelőség a Pest Megyei Kormányhivatalba , a Földmérési és Távérzékelési Intézet pedig a fővárosi kormányhivatalba olvad be.
• Az Emmi része lesz a Család-, Ifjúság- és Népesedéspolitikai Intézet, a Türr István Képző és Kutató Intézet, az Országos Betegjogi, Ellátottjogi, Gyermekjogi és Dokumentációs Központ és az Országos Tisztifőorvosi Hivatal.
• Az Országos Egészségbiztosítási Pénztár (OEP) pénzbeli ellátásokkal, baleseti táppénzzel és utazási költségtérítéssel kapcsolatos feladatait az Országos Nyugdíjbiztosítási Főigazgatóság veszi át, ami legkésőbb január 1-től Nemzeti Családtámogatási és Társadalombiztosítási Hivatal néven működik tovább, ami pedig 2017. március 31-i határidővel a Magyar Államkincstárba olvad.
• Az OEP egyebekben az Emmi része lesz.
• A Belügyminisztériumba olvad a Közszolgálati Személyzetfejlesztési Főigazgatóság és a Közigazgatási és Elektronikus Közszolgáltatások Központi Hivatala.
• A Bevándorlási és Állampolgársági Hivatal állampolgársági és névváltoztatási feladataiban a kormányhivatalok, illetve a járási hivatalok járnak majd el.
• A belügyminiszter anyakönyvi, névváltoztatási és állampolgársági feladatai a Miniszterelnökséget vezető miniszterhez kerülnek.
• A Honvédelmi Minisztériumba olvad több, jelenleg is HM-es hivatal, így például a HM Nemzeti Rendezvényszervező Hivatal.
• Az Igazságügyi Minisztérium irányítása alatt álló Igazságügyi Hivatal az IM-be kerül, az Igazságügyi Szakértői és Kutató Intézetek pedig összeolvad a BM-irányítás alatt lévő Bűnügyi Szakértői és Kutatóintézettel.
• A Külgazdasági és Külügyminisztériumba olvad a Balassi Intézet, a Külügyi és Külgazdasági Intézet feladatait pedig a Demokrácia Központ Közalapítvány veszi át.
• A Miniszterelnökségbe olvad a Közigazgatási és Igazságügyi Hivatal, valamint a Forster Gyula Nemzeti Örökségvédelmi és Vagyongazdálkodási Központ.
• A fővárosi kormányhivatalhoz kerül a Magyar Kereskedelmi és Engedélyezési Hivatal, és a kormányhivatalok járnak majd el a Nemzeti Szakképzési és Felnőttképzési Hivatal hatósági feladataiban is.
• A Nemzeti Fejlesztési Minisztériumba olvad a Közlekedésbiztonsági Szervezet, a Közlekedésfejlesztési Koordinációs Központ, a Nemzeti Fogyasztóvédelmi Hatóság és a Nemzeti Közlekedési Hatóság.

(Közlöny, Index)